داستان انیمه به صدها سال قبل باز می‌گردد. جایی که انسان‌ها بدست تایتان‌ها کشته می‌شدند اما عده اندکی از آن‌ها موفق شدند در شهری با دیوارهای بسیار بلند (حتی بلندتر از بزرگترین تایتان‌ها) پناه بگیرند و جان سالم بدر ببرند. صد سال به همین منوال می‌گذرد تا اینکه…
قسمت آخر فصل 3 اضافه شد.
«پیتر پارکر» به زندگی معمولی خودش ادامه می دهد تا اینکه یک کمپانی مرموز به نام «اوسکورپ» افرادی را با قدرت های خارق العاده برای مقابله با پیتر می فرستد …
هشت سال بعد از اینکه بتمن تمام جنایت‌های هاروی دنت را گردن میگیرد، رهبر گروهی از تروریست ها بنام بین، شهر گاتهام را ویران میکند و اینگونه است که شوالیه تاریکی برای محافظت از شهر باز می‌گردد…
یک نوجوان دبیرستانی خجالتی و ترسو بعد از اینکه توسط یک عنکبوت جهش یافته گزیده میشود، خصوصیاتی همانند عنکبوت ها در بدن خود مشاهده می کند. بعد از حادثه غم انگیزی که برای خانواده اش رخ می دهد، او تصمیم می گیرد از این توانایی های منحصر به فردش، همانند قهرمان‌ها در مقابل انسان های شرور استفاده کند.
در این فیلم که روایت متفاوتی از داستان مرد عنکبوتی است، «پیتر پارکر» مدارکی را بدست می آورد که ممکن است به کمک آن ها بتواند دریابد که پدر و مادرش چگونه در زمان کودکی او ناپدید شده اند. او در همین راه با دکتر «کرت کانرز»، که شریک سابق پدرش بوده، آشنا می شود …
پیتر پارکر پس از تجربه ای که با گروه انتقام جویان داشت به خانه بازمیگردد تا با عمه‌ی خود زندگی کند. او در همین حال که تحت نظر مربی اش تونی استارک است، سعی میکند با هویت تازه اش کنار بیاید…
پس از حوادث فیلم "انتقام جویان: پایان بازی"، مرد عنکبوتی باید برای از بین بردن تهدیدات جدید، در دنیایی که برای همیشه تغییر کرده است قدم بردارد.
